天皇陛下の即位に際して休日が増えることに伴い、平成31(2019)年4月28日(日)～令和元(2019)年5月6日(月)までは全て祝日となり、休日ダイヤでの運転が原則となる。ただし、病院や市場、ごみ処理や湾岸部の施設など一部は通常通り稼動することに伴い、以下の一部系統では休日以外のダイヤでの運転となる。また、深夜バスは全系統で運休となる。詳細は以下の通り。
また、5月6日のみ[学02](高田馬場駅～早大正門)は早稲田大学の登校日に伴い土曜ダイヤとなる。
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休日ダイヤでは運休となる[井98]が旗つきで走るなど非常に珍しい姿が見られた。なお、祝日と祝日の間に挟まれて国民の祝日扱いとになった4月30日・5月2日に関しては、国旗を掲出せずに走った。
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・[市01][陽12-2](新橋駅・東陽町駅～豊洲市場)・[品98](品川駅港南口～大田市場)…4/29, 5/2, 5/3, 5/6が市場開場日となるため、臨時ダイヤで運転
・[AL01](東大島駅～小松川循環)…通勤対応で4/30, 5/2にも運転
・[学01][学07](上野公園山下・御茶ノ水駅～東大構内)…4/30, 5/2が東大病院診療日となるため、平日ダイヤで運転
・[東43](東京駅北口～荒川土手など)・[端44](駒込病院～北千住駅)…4/30～5/2が駒込病院診療日となるため、土曜ダイヤで運転
・[王55](池袋駅東口～新田一丁目)・[王57](豊島五丁目団地～赤羽駅東口)…通勤対応で? 4/30～5/2は臨時ダイヤで運転
・[井98](大井町駅東口～大井水産物埠頭)…通勤対応で4/30～5/2は土曜ダイヤで運転

▲珍しい旗つきの[井98]